2009年通過開發的中科四期，一路歷經了廢水排放、土地徵收等爭議，至今，相思寮徵收戶的問題，依然沒有解決。三戶散戶，在14日被迫拆遷，接受中科管理局以地易地的方案，居民得先拆掉自己住了幾十年的房子。
在土地徵收與廢水爭議之外，中科四期還存在著一顆攸關科學園區能否順利開發的未爆彈，就是水源。位於長期地層下陷、水源嚴重不足的中科四期二林園區，開發過程中，曾經多次被環評委員質疑開發後的用水來源。許多居民也認為，未來中科四期進駐後，將抽用地下水導致地層下陷更嚴重。
當初中科表示，絕對不會抽地下水，未來將使用水利署為國光石化規劃的大度攔河堰。當時大度攔河堰和國光石化都在環評階段，民間團體不斷質疑，水對工業區相當重要，大度堰還沒通過，怎麼確定一定有水？不過中科最後依然以大度堰作為長期水源的條件闖關。不料，今年四月，國光石化宣佈撤案，因為當初國光規劃的用水量，佔大度堰供水量，將近三分之二，現在如果只為中科開發大度堰，必須耗資兩百多億。水利署，如今進退兩難。
雖然沒有長期水源，中科卻依然持續開發工程；因為環評結論允許中科四期，得以在大度堰開發完成前，向農田水利會和自來水公司挪用水源。其中短期開發的6.65萬噸水源，將由彰化水利會從莿仔埤圳調用。
莿仔埤圳，從乾隆時期就由彰化居民自行建設。日據時期，日本政府在濁水溪下游築起提防、河床新增許多開墾腹地。為了墾荒，日本人要求當時的管理者葉惠清交出管理權，將莿仔埤圳設為官圳，這也是台灣民設官管埤圳的開始。日本人接管之後，擴增莿仔埤圳的引水規模。
莿仔埤圳的源頭，就在彰化溪州鄉，一路流向埤頭、竹塘、二林、大城再出海；靠著濁水溪水，彰化成為糧倉。曾經台灣每十粒米，就有一粒是濁水米。其中溪州米更是獲得好評，彰化縣農業處畜產科科長林福地表示，沿莿仔埤圳的田，因為濁水溪水豐富的礦物質成份灌溉，「在全省很出名，大家都在吃。」甚至沿莿仔埤圳沿岸的鄉鎮，都能打出自有品牌外銷。
但是，中科四期要調用居民農業用水這件事，居民不但不曉得，還被欺騙。彰化縣溪州鄉民鄭達展，是管理莿仔埤圳水門的管理員。他的家就在莿仔埤圳附近，當天記者到水門拍攝時，鄭達展和其他鄰居紛紛抱怨，「政府根本都在騙人！」
鄭達展說，中科為了調用農用水，要從莿仔埤圳的源頭，做地下引水工程。這工程長達23公里，居民卻不知道。莿仔埤圳離居民的房子只有一條小馬路，為了施作工程，必須開挖馬路，居民卻一直到承包商來測量，才知道有工程。
鄭達展曾經去詢問當地立委鄭汝芬工程內容，「但她跟我們說，那些水是要給中科的民生用水」，而且開挖面積不大，只有30公分，「我那時跟他說，如果只有30公分你不用跟我們講啊！又沒有影響。」但等到真正開挖，才發現開挖面積是120公分，距離民宅非常近。「而且我們之後才透過其他鄉民得知，這個水根本是要給中科的工業用水！」鄭達展氣憤的表示：「這樣來搶農業水，真的很不合理！」
「目前莿仔埤圳，只吃四天水，八堡圳吃六天水，我們的水已經常常不夠用！」管水門的鄭達展形容，「每次停水後水要來，農民都在這裡等水，水一來，大家就很期待，因為(田)很口渴，我們大地、作物，都趕緊要用水！」
這樣急迫的農業用水，真的還有餘裕空間，供給工業使用嗎？
