蘭嶼的芋頭品種跟台灣完全不同。早在1945年，日本人類學者鹿野忠雄到蘭嶼調查，發現蘭嶼有五種水芋、五種旱芋。近年來，林試所植物園組組長董景生等人到蘭嶼調查發現，現在的品系比以前更多，光是水芋就有十二種、旱芋也有九種，這些品種早年跟著南島民族漂洋過海，從菲律賓等地帶來蘭嶼，被保留至今。
蘭嶼的婦女會依照每塊田的水質與土壤特性去布署、種植適合的芋頭。因為種類不同，生長期也有差異，有的一年多，有的需要二到三年才能收成。蘭嶼平均每位婦女會保有五、六種芋頭，因為品種多樣，芋頭可以適應小島各種環境考驗，而且從葉子到根都可以食用。
芋田的管理蘊藏著代代相傳的智慧，達悟人不使用農藥和除草劑，靠著婦女們勤勞的雙手，維持整齊與美麗。她們將雜草區分為好草、壞草，拔除壞草留下好草，也利用植物相剋的原理，讓好草壓抑壞草。
因為不使用農藥，蘭嶼的芋田也是各種生物的家，田裡有蜆、田螺，田邊的縫隙常躲著鰻魚與螃蟹。每年四月的螃蟹節，婦女們會製作芋頭糕，以蒸熟的螃蟹加上美味的芋糕，慰勞男性的辛苦。
達悟人一生的每場儀式中，芋頭都扮演重要的角色。在傳統的達悟文化中，芋頭不但是食物，也象徵著一個人的能力，甚至是一個家庭的身分地位。
早期蘭嶼芋田面積廣大，因為生態平衡並沒有嚴重的病蟲害問題。但是近來或許因為氣候變遷，病蟲害卻面臨失控的狀況。蘭嶼人稱芋頭的蟲害為Icik，這些害蟲包括條斑飛蝨、斜紋夜蛾、根螨、葉螨、蚜蟲等等，蟲吃掉芋頭的嫩葉，再加上外來種金寶螺(福壽螺)入侵，啃食芋頭的莖，導致底下的芋頭也跟著腐爛。
達悟人擔憂蟲害不但侵蝕芋田，也侵蝕了伴隨芋頭而構築的生活文化。有些人開始使用化學農藥，但這些系統性的農藥，恐怕對生態產生衝擊。是不是有辦法能在友善耕作，維護生態多樣性的前提下，解決蟲害的問題呢?
農委會藥物毒物試驗所生物藥劑組組長謝奉家建議，目前有許多生物防治的技術，可以給蘭嶼族人參考。像是以費洛蒙捕捉害蟲，或是利用一些生物農藥，包括蘇力菌等，不會有藥物殘留也沒有抗藥性的問題，可以讓特定的害蟲減少，但不會傷害田間其他生物。目前農委會推廣有機耕作，對這些生物防治資材也有補助。
除了病蟲害的威脅，近年來因為外來文化影響，蘭嶼的主食也漸漸被米飯替代，現在在蘭嶼吃芋頭的機會越來越少。在地業者開始推動芋田體驗行程，希望觀光客來到蘭嶼，除了親海，也能認識這裡的芋世界，讓更多人知道芋田蘊涵的文化傳承與生態多樣性的價值。
