瑪鋉溪總長大約七公里，上游流經陽明山國家公園，環境原始，下游是有名的溪釣場域。位在溪畔的萬里國小中，有幾位喜愛釣魚的老師，將釣上來的魚養在學校的魚缸裡，建置了瑪鋉溪的溪流生態缸， 希望能幫助小朋友多了解家鄉。
萬里國小的廖健佑老師認為這樣剖面的呈現，能徹底了解溪流的原始地貌。在瑪鋉溪的下游還能釣到這麼多種類的魚，在野溪飽受污染的台灣，真的非常難得。然而，溪水並不是時時都乾淨，萬里國小的老師釣魚時，常遇上溪水忽然變濁的情況。
2008年1月16日，萬里的天空飄著濛濛細雨，瑪鋉溪的溪水混濁，看起來的確有些不尋常。沿著瑪鋉溪畔，有三個合法的瓷土礦場，露天採礦直接用怪手開挖，大片裸露的山壁，看來觸目驚心。同一天，流經礦區的水像泥水一般，但是礦區以上的上游，溪水卻是清澈見底。
為了追查礦場是不是造成溪水變濁的原因，我們進入礦場了解實際運作情況。位在瑪鋉溪中游的宏洲礦業，開採的是瓷土與矽砂，產品有部分需要沉澱處理，其他則是直接運出。宏洲礦場負責人林瑞祥表示，村民認為他的放流水污染水源都是誤解，如果下雨天多少會流出去，平常砂都撈起來販賣，不可能讓它放流。
宏州礦場曾被檢舉過量盜採，經由礦務局人員現場會勘，證實都在合法範圍內採礦。歷年來放流水的水質報告，也都符合台北縣政府的標準。
不過，位在崁腳派出所對面的大同瓷土礦，運作情形則有些不同。採下來的礦土經過碎解、運至沉澱池，經過沈澱、濃縮，再經由壓土機製成泥餅，沉澱池中的水，都循環回去做洗砂功能，沒有放流。而礦場內的廢水逕流，則是集中到沈沙池處理，收集沈澱之後，上層比較乾淨的水放流到溪裡面，沈沙的沈澱物，會定期做清除。不過大同礦場由於部份設備不符規定，放流水確實污染水源，元月二日已經被停工處分。
另外，去年12月台北縣環保局接獲中幅淨水場多次通報水源濁度飆高，調查後發現，污染源來自這個礦土堆置場。台北縣環保局稽查科甘偉文表示，業者，取水洗砂，廢水直接排放到瑪鋉溪，經採水化驗證實之後，依據水污染防治法，做告發處分。告發後，這個小型洗選場停止運作，環保局也與鄉公所清潔隊合力監督，不過還是防不勝防。中幅淨水場的人員表示，溪水濁度飆高的情形還是會發生，而且大多是在夜間。
瑪鋉溪是新山水庫的水源之一，屬於水源保護區，溪水經中幅淨水場處理，供給基隆地區使用。由於取水口在礦場下游，礦場廢水排放，影響的是基隆的民生用水。
順水而下的沙土，逐漸沈積，雖然不含有害物質，卻還是影響著溪流生態。萬里居民表示，以前溪中的魚蝦有縫隙可以躲，礦場廢水夾帶的砂會將石縫堵住，現在魚蝦數量下降很多。
採礦的噪音以及大型車輛進進出出，引發居民強烈反彈，為了緩解居民情緒，縣府規定大型車不得行使部分路段。即使在交通與水土保持上都嚴加管制，但是居民的立場，還是希望停止採礦。
面對地方意見，業者滿懷無奈，其實礦業的經營也是困難重重。宏洲礦場負責人林瑞祥表示，有時流氓來卡油，有時官員來找麻煩，做礦20多年，欠人家一千多萬，如果有補貼，寧願不要做。
如果從經濟面來考量，這些礦物有其市場需求，如果國內無法生產，就必須仰賴進口，礦務局希望能尋求折衷之道，降低開採過程的衝擊，盡力將景觀恢復到更好。
在瑪鋉溪的支流上，則有另一個問題，縣府設立了一個建築廢土棄置場，預計容納90萬立方的土方，但是不遠處的山谷下方，就有個小聚落 。廢土場的所在位置不理想，雖然是合法設立，但對社區安全確實產生威脅。而在水源保護區內有礦業開採，也有其矛盾之處。這些產業的設置，影響著集水區，政府必須有更謹慎的規劃。
瑪鋉溪是基隆的重要水源，也是萬里居民鄰近的親水空間，難得的是，大部分河岸還保留著原始風貌。這裡遭遇的問題，是許多溪流命運的縮影，提醒我們，任何影響溪流的作為，都需要仔細思量。
側記
瑪鋉溪是我溯溪初體驗的溪流，位在台北近郊卻有著高山溪才有的峽谷景觀，小而險，成為著名的溯溪聖地。由於親自走過，在情感上產生深刻連結，從平面媒體得知它中下游地區發生污染疑雲，讓我立刻想要一探究竟。每一條溪流都蘊含特殊的美麗與豐沛的生命力，我們能做的是將污染實情報導出來，吸引更多人來合力捍衛。
