用過燃料棒卡滿燃料池 核二1號機組提早停機
2021年7月1日，核二廠1號機，因為用過燃料池容量不足，燃料無法退出而停機，形同提早除役。核一、核二廠陸續進入除役階段，不過除役的關鍵核燃料，還沒辦法取出。
核二廠提前除役，其實早在預期之中，因為核一、核二廠一開始燃料池的設計，就只夠存放二十年的用過燃料。為了讓核電廠繼續運轉，台電以加密的方式，增加燃料池容量，核一廠燃料池從原本的1410、1620束，增加到3083束，核二廠則從原本的2571束增加到3660束，再增加到4398束，最後兩部機組的裝載池，也改裝存放440束用過燃料，可以說是運用到極致。
乾貯設施卡關 難以進展下一步
台電無奈表示，核一、核二核燃料無法從燃料池取出，主因是乾貯設施在新北市政府卡關。新北市府則表示，核一乾貯當初是台電沒有按圖施工，後續水土保持審查，因為安全考慮所以沒有同意。新北市消防局副局長李清安指出，核一室外乾貯的水保缺失，包括侵蝕範圍低估、岩石強度高估、邊坡穩定微型樁強度高估、地下水壓力低估等，要求台電改善，但台電並沒有達到要求。台電則認為新北市標準前後不一，提起行政訴願，農委會做出「原處分撤銷，另為適法之處分」，但新北市堅持台電重送水保申請。
水保計畫卡關，新北市核安委員和學者也對乾貯的設計和地點，提出疑慮。2017年6月暴雨襲擊北海岸，核一廠西側山坡因為土石沖刷，導致2號機聯外電塔倒塌，2號機自動跳機。
電塔倒塌事件讓民間團體對室外乾式貯存的安全性更加擔憂。民間團體和新北市府建議，核一、二室外乾貯應該改成室內，以降低風險。2016年9月，前行政院長林全為解決核廢問題，就曾到北海岸與居民對談，當場指示乾貯第二期應從室外改成室內。
到目前為止，核一核二室內乾貯還在準備招標的規畫階段，預計分別在2028年、2029年才能啟用。台電還是寄望室外乾貯能先啟用，讓反應爐爐心的燃料棒移出。
另外，核一燃料池內放滿6000多束用過燃料，反應爐內也有700多束燃料無法退出，這種狀況下，目前核一除役只能先從拆除電塔、氣渦輪機和汽機廠房開始。
2023年核二廠屆期也將停止運轉 核燃料去處仍是未知數
即將除役的核二也面臨相同難題。核二的室外乾貯因為新北市不核准逕流廢水削減計畫而無法興建。新北市消防局副局長李清安表示，新北市不反對室內乾貯，但核燃料移到乾貯之後，下一步又在哪裡？
由於高階核廢料的選址是四十年以上，甚至跨世代的工程，民間團體呼籲要制訂法令並建立專責機構。2015年，立委與學者專家曾提出「高放射性廢棄物最終處置場址設置條例草案」和「放射性廢棄物管理法草案」，經濟部也提出「放射性廢棄物管理中心設置條例草案」，但多年過去，高階核廢料的立法，始終沒有進展。
台電核後端營運處處長張學植認為，無法可循，是造成高階核廢選址困難的一大因素。但原能會表示，瑞典、芬蘭同樣沒有最終處置場選址法規，但因為有良好的社會溝通，一樣可以進行選址作業。
北海岸反核行動聯盟執行長郭慶霖呼籲，行政部門和立院，應該盡快完成核廢三法，如果連法源都沒有，如何能讓地方居民相信，核廢料會有離開電廠的一天？
最終處置場址難產 核後端經費大幅增加
由於核廢料最終處置選址的不順利，核電除役以及核廢料處理費用也大增，核後端經費從原本預估的3300億元，到2020年增加為4729億元，後續經費還在重新估算中。
核電除役除了錢的問題，人才、技術，也都是新的考驗。2021年初，核一廠爆出，廠商進行土壤輻射檢測調查時，挖破冷卻水管線的意外，雖然沒釀成災害，卻引發外界對核電除役管理的擔憂。郭慶霖認為，因應除役需要，台電必須進行組織重整、培訓除役專業人才，並成立中央層級的除役委員會，讓地方政府、居民、學者共同參與監督。
一座核電廠運轉期間40年，除役期間長達25年，核廢最終落腳何處，卻仍是未知數。漫長的除役旅程需要專業人力，更需要社會的討論，來面對接下來的旅途。
