國內有近六成保育類野生動物棲息在淺山地區，與多數農田高度重疊，而臺灣農田面積約占總面積24%，除了肩負經濟生產，也同時具備串連鄰近森林、溪流、濕地等環境作用，因此民間私有地如果也能成為保護區的一環，藉由民間力量保護區的範圍，跨足農業操作與生態保育等面向，就能填補保護區外的漏缺之處，讓更多農田成為生物庇護的「農田方舟」。
以保育類赤腹游蛇為例，過去經常能在池塘、草澤、水田等淡水濕地見到，因為棲地開發、農藥污染等因素，導致野外族群量銳減，在陽明山上，使用水耕方式的「溼地型」海芋花田正是棲地之一，藉由友善海芋栽培管理模式，將有助於赤腹游蛇生存與棲地存續。
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林業及自然保育署與慈心有機農業發展基金會合作，2009年推出綠色保育標章，輔導農友轉型友善耕作，耕種過程不使用農藥、除草劑、化學肥料，農產品必須無農藥殘留，提供保育類野生動物覓食、繁殖、育雛的環境，兼顧農業生產與保育，目前已推廣至全台675位農民、友善農田面積超過938公頃。
2021年起進一步推動「瀕危物種及重要棲地生態服務給付推動方案」，給付標的物種包含赤腹游蛇、食蛇龜、諸羅樹蛙等保育類野生動物，透過「生態薪水」的方式鼓勵民眾對瀕危物種族群及重要棲地進行保護，作為農損補償。
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以赤腹游蛇來說，在陽明山國家公園範圍內，已有20座農場加入這項方案，陸續轉型友善耕作，希望以保育赤腹游蛇為標的，營造友善的棲地，讓更多生物可以在這裡安心的生活。
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