民國九十年一月十四日，強勁的東北季風持續吹襲，希臘籍阿瑪斯貨輪因為機械故障失去動力，已經在海上漂流了二天。接近黃昏時刻，季風及海浪將阿瑪斯推向岸邊，致使船身擱淺在水深約20米的礁岩上，船長發出求救訊號，海巡署接獲海難事故通報之後，海巡隊的巡邏艇在晚上十一點多，冒著八、九級大風浪，將待在傾斜船身，等待救援的船員一一救起。
一月十五日，強勁的東北季風並未減緩，阿瑪斯貨輪受不了強風大浪的襲擊，持續傾斜，機艙內的重燃油，就從破損的船身慢慢滲漏出來。
一月十六日，在墾丁龍坑生態保護區靠近海岸的步道，已受到重油污染並可聞到汽油味的現象，龍坑保護區管制站人員回報保育課。
一月十七日，墾丁國家公園保育課人員至現場拍照紀錄，並呈報管理處。
一月十九日，國家公園警察隊開出第一張生態保護區污染告發單。
一月二十五日，農曆年初三，臨時除油工人開始著手除油工作。
根據了解，在油污染的前期關鍵時刻，環保署長、內政部營建署長、屏東縣長等相關首長相繼出國渡假，交通部因為收文人員已下班，來不及轉呈，墾丁國家公園也僅由值班人員就近監測。雖然污染情形均已通報各相關權責單位，但因為各單位正準備休年假，無法即時反應，致使污染範圍持續擴大，並喪失處理先機，徒讓單純的污染事件，演變為複雜的政治風暴，同時也讓保護區內的生靈無辜受害。
當一月底，年假結束之後，龍坑的污染事件經媒體大量披露之後，各界為之譁然，終於掀起油污風暴。在野黨也就抓住這個機會大加撻伐，並引伸為海洋污染的八掌溪事件，並轉而要求行政官員下臺。至此，油污染的通報程序、處理方式、責任歸屬、行政缺失等問題，一一被政治口水給掩蓋，加上媒體的炒作，已模糊掉油污事件的真相。
三月初，環保署長林俊義在油污事件中，首先中劍落馬，新聞熱潮也隨著新任署長郝龍斌上台之後，漸趨消退，但船體殘骸的移除，殘油及礦砂的抽除進度並不順利，而宣示性的口號依然響亮，無奈新聞焦點已轉移。
在夏季颱風相繼侵襲南台灣之後，阿瑪斯的船身再也承受不住強浪的襲擊，斷裂、解體、殘骸擴散，鐵片隨潮浪四處衝撞、刮磨，海底生物再度受到摧殘，龍坑保護區又歷經一場生態大浩劫。
阿瑪斯事件過了一年，郝龍斌在九十一年一月十四日油污染週年記者會上，宣示將阿瑪斯擱淺之日，定為「台灣海域受難日」，希望大家記取教訓，同時說明船體、殘遺礦砂已無任何危害，並宣示將繼續向船公司求償並盡速移除船體殘骸。但根據實地調查，船體殘骸在海底的危害並未稍減。
九十一年六月初，媒體再度報導阿瑪斯貨輪的殘骸大多已被打撈上岸，並運往高雄港區處理，環保署也通知各單位準備結案。但根據了解，阿瑪斯貨輪的船體約二萬一千餘公噸，目前打撈起來的殘骸約一千多公噸，充其量實際打撈起來的殘骸也才十分之一而已，如何就此結案呢？龍坑海岸的珊瑚礁岩雖然已陸續恢復生機，但大部分人看不到的海底，其實仍然危機重重。
阿瑪斯的船體殘骸以及鐵礦砂，目前，雖然大部分仍遺留在海底，但是環保署長及交通部航政司官員，均宣稱目前該地區已無污染存在。據實地瞭解，阿瑪斯貨輪的殘骸，在海底滾動、衝撞了近兩年，已裂解成六截、十七塊大殘骸，以及難以計算之小鐵片，幾乎已看不出船體的形象。這些殘骸主要散佈的範圍約370公尺乘以250公尺，離岸約1到1.4公里，水深11.5米到16米之間，初步估計，遭到破壞的面積約一萬八千平方公尺。
而這些殘骸鐵片隨著潮浪翻滾、衝撞，除了刮除附近礁岩上的生物及活珊瑚以外，鐵礦沙和金屬的船殼，受到海水浸泡之後，會逐漸的鏽蝕，大量的鏽水或金屬離子會進入附近的海域，珊瑚礁及魚苗都會受到影響。而負責船貨移除的交通部官員表示，因為船貨移除經費400多萬美元已快用光，受限於經費問題，已決定將這些殘骸礦砂留在原地，充作人工魚礁，不再加以處理。
另外，有關求償的問題，國防部、交通部、環保署等政府部門，花在油污清理的費用，超過9,000多萬元，但船主保險公司實際只賠償了6000多萬。而第二階段求償部分，如海域污染造成之生態環境損失、恆春地區漁業經濟損失、屏東縣環保局罰款一億五千萬、墾丁龍坑受污染區的生態復育及監測經費等部分，因為缺乏龍坑受到污染之前的環境調查記錄，求償談判的進度相當緩慢。
目前，龍坑海岸的潮間帶，雖然已陸續恢復生機，但公部門對於後續污染問題，似乎避重就輕。譬如，破碎解體的殘骸，仍然隨時會移動，怎麼做為人工魚礁呢？而龍坑潮間帶，在受到污染之前，並沒有完整的生態基礎資料，兩年以後，又依據什麼樣的判斷，認為生態環境大致已復原了呢？另外據了解，類似阿瑪斯第三級的海洋油污染事件，台灣在未來五年，都還無法自行處理，雖然環保署已花費了近三億元的訓練及設備經費，但目前，還是必須仰賴國外專業除油公司的支援。
環保署長宣示「台灣海域受難日」的意義，應該是希望在失敗的例子中，吸取經驗，不要再讓類似的污染事件重演。但是事隔兩年，龍坑海底的危機仍未完全消失。而阿瑪斯貨輪油污染事件，已漸漸被人遺忘。值此關鍵時刻，實際參與除污工作的人，血汗不能白流，我們有責任將阿瑪斯貨輪，後續污染的問題提出來，才得以告慰已被犧牲的海洋生靈。
