位於花蓮縣卓溪鄉的豐坪溪水力發電開發計畫，預計興建兩座34.5公尺、44.15公尺的攔河堰，再把水引入引水隧道，利用高低差發電。兩部機組裝置容量分別是一萬八千一百瓩、一萬九千瓩，年發電量1.64億度，約占花蓮總用電量的6%。
部分居民認為，電廠可以為部落帶來發展機會，但也有居民擔憂，引水發電會影響灌溉水源，甚至衝擊河川生態、影響狩獵文化傳承，並質疑當地容易崩塌的地質特性，是否經得起工程擾動？
對於這些擔憂，廠商回應未來若發生水源不足的情形，會以居民灌溉需求為優先，而兩座攔河堰的高度只有石門水庫的十幾分之一，並且是由國內很有經驗的工程公司設計、監造，居民不必擔心安全問題。
其實豐坪溪水力發電開發計畫，1999年就已經通過環評；但在2005年，因開發商世豐電力股份有限公司，取得開發許可後超過三年才動工，違反環評法16-1條被勒令停工；環保署督察總隊後來證實，廠商2009年補做環境現況差異分析報告後，並未實質復工，直到2019年，世豐被正崴集團收購，才於同年3月恢復施工階段的環境監測。
環評法16-1條的立法用意，是因為自然環境會不斷改變，如果一個開發案通過環評後，很長一段時間沒有動工，要開工時就必須先確認，環境條件是否與通過環評的時間點，沒有太大差異。
部落居民指出，豐坪溪沿岸的崩塌、淤積情形，都已經與十年前不同，理應再做一次環境現況差異分析，但環保署綜計處長劉宗勇表示，現行法規設計無法要求同一個案子做兩次環現差，若開發行為對環境造成影響，環評法18條可以發揮把關作用。不過前環保署副署長、律師詹順貴認為，回歸到16-1條的立法精神，若一個開發案確實將近十年都沒有動工，還是有必要再做一次環現差。
東部河川固然蘊藏豐沛水力，但快速變動的地質與氣候變遷因素，也為電廠開發增加許多不確定性。花蓮縣萬榮鄉萬里溪的西寶水力發電計畫，是另一個例子。
這個計畫是台電從2001年開始推動，預計以4.7公里長的引水隧道，從馬太鞍溪越域引水到萬里溪上的西寶壩發電，不料才動工一年，2004年壩址預定地就發生嚴重崩塌，因地質破碎、下游鳳林鎮、光復鄉等地居民擔心灌溉用水受影響等爭議，電廠預算於2005年被立法院刪除。
2010年，台電取消越域引水工程，提出「萬里水力發電計畫」，預計在萬里溪上興建6到13公尺的攔河堰，將水引入六公里長的頭水隧道，利用落差發電。雖然縮小了工程規模，裝置容量也從7.4萬瓩減少為4.9萬瓩，仍因爭議過大，於2011年被環保署裁定須進入二階環評，目前仍在審議階段。
鳳林鎮居民張國仁，是反對西寶計畫的老將，他認為萬里溪旁的萬榮林道，有多處反覆崩塌，未來電廠興建、營運都須仰賴這條道路，為了維修林道所投入的成本，會讓這個電廠完全沒有經濟效益。
台電營建處處長張劉國表示，以目前的工程規劃，壩址與電廠設備都不是位於地質敏感區，另外會編列三億元經費開鑿隧道，避開崩塌最嚴重的萬榮林道18公里處。考量到電廠興建後，每年將可減少九萬噸二氧化碳排放、減少自西部輸電導致的線路損失6.3百萬度電，萬里水力發電廠仍具開發效益。
萬里溪與豐坪溪的水力開發計畫，都已經爭議多年，近年一方面因為適合設置大型水力設施的地點幾乎都已開發完成，一方面政府也意識到，興建大型堰壩造成的環境與社會衝擊，因此在行政院2020年核定的《能源轉型白皮書》中，提及水力發電未來將朝「小水力」方向發展。
@台東縣海端鄉 關山圳水力發電廠依據〈再生能源發展條例〉，小水力發電指的是利用圳路或既有水利設施，設置未達二萬瓩之水力發電系統。台東關山水力發電廠，是再生能源發展條例通過後，第一個利用既有圳路發電的例子，從2019年起，為台東兩千多戶家庭提供民生用電。關山水力發電廠是利用水圳沉沙池與進水口之間十公尺的落差發電，水只是在流進田裡之前先通過水輪機，對灌溉完全沒有影響。
小水力發電的優點是對環境衝擊小，但相對的裝置容量比不上大型水力設施，按照政府2025年再生能源要占比20%的目標，水力發電裝置容量要從現有的2093MW 提高到2150MW，如果全靠小水力，能夠達標嗎？
台電電源開發處水力電源組組長張膺燦表示，目前台電和水利署北區水資源局、中區水資源局合作，利用鯉魚潭水庫、湖山水庫、集集攔河堰等既有水利設施設置的小水力發電，合計約十個案場的裝置容量僅有25MW左右，與目標仍有一段差距。能源局副局長李君禮則表示，豐坪溪與萬里溪的水力發電廠，完工後都會被列入再生能源水力發電目標裝置容量。
但萬里計畫的裝置容量超過兩萬瓩，並且和豐坪溪水力發電計畫一樣，都會建壩攔水，顯然不符合〈再生能源發展條例〉的定義，與目前的政策方向，是否有所矛盾？
李君禮說明，〈再生能源發展條例〉中的定義，指的是「政府獎勵、鼓勵」的水力發電類型，即使豐坪溪與萬里溪的水力發電廠不在獎勵範圍內，仍然算是再生能源。不過地球公民基金會花東辦公室主任黃斐悅、東華大學環境學院榮譽教授夏禹九都認為，台灣沒有大型人工構造物的溪流已經所剩無幾，在天然溪流上建壩，不應該算是再生能源。
台灣水力發電的歷史，已經超過百年，如今我們似乎正來到一個十字路口，是要繼續建壩攔水，或是以積少成多的方式，把設置在既有設施小水力的潛力，發揮到最大？為了迎接水力發電的明天，我們又能留下幾條自由流動的河流？
