台南西港養雞場的陳老闆，一早巡視雞場，發現許多雞隻死亡，二十多年養雞的經驗，看見雞隻死亡的怪異樣子，讓他感到緊張的氣氛，甚至有種大禍來臨的感覺。他回到家中撥通電話，請求檢疫所人員前來幫忙，他告訴檢疫人員，「有些事情不對勁！」。
今年一月，台灣南部地區發現雞隻異常死亡現象，防疫專家檢驗之下，發現一種名為H5N2的流感病毒已經入侵台灣，它在禽類中交互感染，一經感染立即死亡，造成生態環境的重創。但是更讓專家擔心的，是這個病毒家族中，另一種名為H5N1病毒，因為它跨越人禽的物種藩籬，直接攻擊人體，造成的傷亡將是難以估計。
面對禽流感病毒的入侵，防疫機制快速啟動，但是在這場人類與病毒的戰爭中，讓我們以病毒的角度，循著雞隻流通的管道，審視這套機制是否全力發揮作用？
病毒，一種完美的生物體，它有著簡單的生理構造，快速的異變能力。千百萬年來，它們繁衍出無數的病毒家族，以不同的類型組合，一波波侵襲各個物種，造成的傷亡遠遠超過人類歷史相互征戰的總和，它們的肆虐就為了一個簡單的目的--生存，找尋新的宿主讓病毒家族存活下去。
一隻隻味道鮮美的雞，提供病毒一個不錯的生存環境，因為擁擠的雞舍加上龐大的雞群，讓病毒可以大量繁衍，更重要的是這些肉用雞隻，為求快速成長立即上市，雞隻的免疫力降低，讓病毒的入侵毫不費力。
那麼不動聲色潛伏在雞隻身體裡，直到雞隻發病死亡，雞場的主人聯絡檢疫單位，檢疫人員帶走病死雞化驗，雞場全數被管制移動，病毒無路可走，等待隨著雞隻全數撲滅，病毒戰爭的完美結果。
但是一切沒有那麼簡單！在這條防疫線上，最前線的檢疫人員嚴重缺乏，面對大大小小、合法非法的養雞場，他們根本不可能一一檢查，完全依賴雞農主動的報告。但是在雞農的日常經營裡，雞隻患病先是以經驗投藥，再找藥廠或獸醫診斷，最後才會找上政府防疫單位，再等到檢疫單位經過一星期的檢疫流程，這些時間足夠讓病毒擴散，不管是透過隨風吹動的羽毛、前來雞舍偷吃的野鳥，或者疫區進出的人車，病毒總可以找到它的交通工具。
另外，在經濟的考量下，並非所有雞場主人都會誠實報告，因為撲殺的經濟損失，讓已經苦撐經營的雞農負擔不起，一旦發現異常死亡現象，在可能全場撲殺的狀況下，少數雞農採取不合作態度，將疑似患病的雞隻快速銷售，於是病毒一路呼嘯在高速公路之上。
夜間，台北家禽市場燈火通明，供應大台北地區食用雞隻的卡車，一輛輛靠近卸貨平台，常駐市場的獸醫師，繞行市場檢視一籠籠的雞隻，他們以雞隻的死亡狀況以及健康情形，作為判斷的依據，但是這樣的檢視方法，對於遭到病毒感染卻未發病的雞隻毫無效果。
病毒又過一關，它們隨著雞隻來到屠宰工廠，在簡易的屠宰動作，所有雞隻混在一起等待上市，病毒在雞肉堆裡四處流竄，隨著雞販的來到，病毒進入日常的小市場中，由於國人習慣食用現宰雞肉，未死的病毒在接觸的一瞬間，可能到了雞販的手裡，或者家庭主婦的菜刀上。
病毒專家最擔心的事，就是此刻，一旦原本僅止於禽傳禽的流感病毒，大量接觸人類，難保病毒不會繁衍突變，形成流通於人類的病毒。面對其他國家開始出現H5N1病毒造成人類死亡事件，專家們擔心最後防線一旦被攻破，H5N1病毒由境外移入，或者在無法控制的H5N2病毒中異變出新種病毒，疫情將更為緊張。
禽流感病毒的肆虐，成為亞洲地區繼SARS之後，最新的疫病難題，各國防疫專家建立一道道防線，全力防堵病毒的擴散及異變。在台灣的禽流感病毒發威，已讓數十萬的雞隻遭到撲殺，但是戰爭仍未結束。專家找不出病毒侵入的途徑，甚至在一間間雞場全面撲殺、消毒之後，發現仍然病毒四處擴散。
面對這場無聲的戰爭，敵人不是凶猛的砲火，而是隱而不見的病毒，它們潛伏、攻擊的能力無與倫比，只要有一絲一毫的疏漏，病毒大軍就可能攻破防線，造成人類世界的大浩劫。如何佈下最嚴密的防線，成為杜絕病毒的首務，這不僅包括政府投入的心力、制度，更包括人性中的誠實與輕忽。
