鱉溪全長近17公里，發源於海岸山脈的最高峰-麻荖漏山，是東部第一大河秀姑巒溪的源頭之一，因為以前很常看見鱉的蹤跡而得名，一整年水量都很豐沛，河道蜿蜒曲折，生養著台東間爬岩鰍、菊池氏細鯽、大吻鰕虎等台灣東部原生魚種，當地居民回憶起早期鱉溪，不只清澈，溪裡有深潭、石頭，棲地多樣，生態豐富。
現在鱉溪的樣貌不太一樣了，溪裡大大小小的石頭越來越少，換成一道一道的攔河堰和固床工，溪畔的緩坡變成高聳河堤，原來散布在河岸兩側的灘地，也變成稻田，溪裡的原生動植物，因棲地環境改變漸漸消失。鱉溪，不再是陪伴大家長大的那條鱉溪。
2018年水利署第九河川局，從局中的經費撥了預算三千多萬元，重新營造鱉溪的自然生態，希望在降低河川災害的目的下，同時把居民和鱉溪的親密關係找回來。
施作項目以豐南社區河岸安全為優先，計畫在右岸興建固床工和護趾工，來保護堤岸，減緩河床往下刷深的速度，同時在堤防上綠美化，闢建景觀步道形成休閒綠廊，左岸的高灘地上，也規劃鱉稻共生環境和生態導覽設施，但是九河局的心意，一開始沒有獲得在地居民的迴響，他們憂心鱉溪會更加人工化，因為台灣各地皆有類似的案例。
例如：台中南勢溪，水質清澈，地下湧泉豐沛，沿岸密密麻麻的坑洞，還是台灣特有種，南海溪蟹的家，2018年台中市政府著手整治南勢溪之後，樣貌大大改觀，挖除兩岸的竹林和有百年歷史的砌石堤岸，填掉南海溪蟹的棲地，重新在河床上種植景觀植物，鋪設大塊大塊的水泥踏石，南勢溪從此被隔離在水泥高牆之外。
為了獲取更多認同，把多元聲音納進來，第九河川局重新審視鱉溪規畫案，再度召開說明會，廣邀在地居民、環保團體和學界參與，並成立鱉溪流域管理平台，細分出河川工程、水質水量、生態復育、農村創生四個小平台。包含林務局、水保局、花蓮縣政府、在地社區發展協會及環保團體等二十六個單位共同加入，彼此共學，決定優先要做的事。
鱉溪上游養豬場的廢水排放，這個困擾居民數十年的老問題，是管理平台瞄準的第一項工作，目前違法排放已經遭到罰款，業者承諾不會再把廢水排放到附近自有的農地，以免外溢到鱉溪，影響水質。
另外，要對抗河川下刷的力量，避免水泥護岸崩塌造成災害，除了興建攔砂壩和固床工，水利部門幾乎沒有第二種方法，鱉溪就是在這樣的工程思惟下，漸漸失去原始生命力，短短九公里內，就有二十三座攔砂壩，政府與民間，大家凝聚共識，希望先還石於河，恢復舊有河相，再研究不影響安全下，拆除壩體的可行性。
要拆除掉攔砂壩或固床工得從長計議，但加寬河道減緩流速，降低河床刷深的速度，是眼前可以辦到的，有許多行水區的河川浮覆地，被開墾為稻田，以往礙於民情，公部門要取締占用或收回租地，都得大費周章，現在有管理平台，可以和社區居民各司其職，目前已經收回兩處高灘地。
除了還地於河，也開始進行生態復育，原來的灘地和水稻田，在九河局雇工購料委託村民們共同整理下，現在是菊池氏細鯽的保種復育池，並且搭建簡易魚梯，讓鱉溪的魚兒，有機會上溯洄游，這種可移動式的魚梯，颱風來了可以搬到岸上，不用擔心損壞，大家邊做邊學。目前攔河堰上，已經是模組化的第二代魚梯。
河川整治不再是合約買斷的工程，過程中透過讓民眾參與決策，與專家學者彼此討論，官方與民間合作取得共識後，再展開行動，期望透過眾人的智慧，讓鱉溪的環境能再豐富起來。
