搭上快艇，澎湖沙港國小老師鄭謙遜，準備前往小白沙嶼，調查島嶼上的燕鷗生態。由於島嶼保持自然原貌，船隻靠岸時必須相當小心，以免觸礁出事。小白沙嶼由於有著壯闊的柱狀玄武岩景觀，在1992年劃為玄武岩保護區，全面禁止登島破壞，多年下來人跡罕至，反而成為燕鷗良好的繁殖棲地。
三十五歲的鄭謙遜，十多年前，進入燕鷗生態調查領域，漫長的研究生涯，讓他走遍澎湖大大小小的離島，記錄觀察燕鷗的生態，成為澎湖燕鷗的生態專家。根據調查，澎湖常見的燕鷗有六種，分別是蒼燕鷗、小燕鷗、紅燕鷗、白眉燕鷗、鳳頭燕鷗、玄燕鷗，在四月到八月間到澎湖產卵繁殖，屬於夏候鳥，其中貓嶼的玄燕鷗備受國際重視。
踏上小白沙嶼，鄭謙遜帶著合法申請進入保護區的研究團隊，開始計算今年燕鷗產卵的巢位。小白沙嶼的燕鷗，以白眉燕鷗與蒼燕鷗為主，產卵在岩縫或草叢中，為了計算產卵數量，走在產卵區，必須萬分小心。
離開小白沙嶼，前往另一處玄武岩保護區雞善嶼。雞善嶼由大、小雞善二座島嶼組成，島嶼沿岸都是高聳直立的柱狀玄武岩，成為澎湖旅遊的知名景點。島上燕鷗族群以紅燕鷗、蒼燕鷗與鳳頭燕鷗為主，在島嶼上選擇不同區域繁殖，不同區位的選擇，成為重要的調查主題。
人員進入棲地，造成燕鷗驚擾，但是為了保護物種，瞭解棲地變化，也只能在研究時，將干擾降至最低。由於鳳頭燕鷗體型較大，較不畏懼人類，對於落單的侵入者，常常以俯衝迫近的方式，威脅侵入者離開繁殖區。研究人員行進時，必須小心腳下的鳥蛋安全，又必須提防頭頂的鳥嘴攻擊，調查過程萬分辛苦。避開鷗群的衝撞，卻沒想到島上偏佈蟻群，過久站立一個地方，蟻群立即爬上腳部叮咬，研究者身體疼痛，卻想到島上蟻群，會不會對孵出的幼雛，造成重大的傷害。
為了瞭解燕鷗遷徙路徑，必須進行捕捉標識的繫放工作。鄭謙遜選定活龍灘的燕鷗群，進行誘捕工作。對於相當敏感的燕鷗，沙灘上的繫放，成為人與鳥鬥智的考驗，縱使有著偽裝帳遮蔽，但是不時前來偵察的燕鷗，彷彿視破人類的詭計。
時間分秒過去，燕鷗始終不受騙入籠，研究者就在高溫的沙灘上，無奈地受著曝曬，於是心急之下，各種怪招出現，包括沙灘曬烏龜的招式。終於，一隻親鳥回巢孵卵，進入籠中受到捕捉，開始進行標放的工作。
進入繁殖季末期，許多雛鳥孵出，在沙灘上自由奔跑，島嶼充滿生命的氣息。沙灘上，人與鳥之間，又緊張又親密的關係，在海角孤島上演，生態的美景，成為動人的影像。
為了燕鷗研究，鄭謙遜考上動物研究所，增進專業知識，但是國小老師的身份，也讓他將研究所獲知識，轉成學童們的課外活動，讓學生接觸屬於故鄉的特有生態。對於孩童們，在炎熱的沙灘上，吃冰好像比賞鳥重要，鄭謙遜只能苦口婆心的教導，希望生態的觀念，能在孩子們心中生根成長。
在這塊燕鷗繁殖區上，實際有不斷上演人與鳥的爭戰，早期島嶼居民踏過灘地，到灘地上撿蛋維生，衝擊燕鷗生態。隨著保育觀念抬頭，當地居民從撿蛋維生轉為巡守保育，但是觀光經濟興起，美麗的灘地，又成人鳥爭地的戰場。
如何在保育與觀光之間，找出一條平衡的線，成為澎湖縣野鳥學會努力的目標，舉辦十多年的賞鷗季，也是為了推廣保育觀念。在一趟貓嶼的賞鷗行程中，冒著海上風浪，大家想一睹台灣最早的燕鷗保護區，看看島上獨特的玄燕鷗生態。在風浪中，鄭謙遜為船上乘客講解燕鷗生態，介紹稀有保育候鳥的玄燕鷗。回程時刻，鄭謙遜疲憊地坐在船上，海上風浪讓人難受，但是燕鷗的生存危機，更讓人擔憂。
隨著研究時間的增加，鄭謙遜觀察紀錄到更多的燕鷗生態，甚至在演講之中，有如介紹自己的海島朋友。保育燕鷗，常常和居民造成衝突，鄭謙遜和許多生態研究者，面臨相同的難題。長期研究的孤單，居民誤解的指責，常常讓許多研究者挫折退縮，但是鄭謙遜堅持信念不願放棄，為著就是孩童時的夢。
在藍海島嶼上，一位老師看著燕鷗漂浪飛舞，也許前來繁殖，也許成長離去，但是在燕鷗伴我行的守候中，藏在依戀故鄉的濃郁心情。
