2014年中油計畫興建第三天然氣接收站，選址在桃園觀塘工業區，由於當地有珍貴的藻礁生態，而引發保育團體展開一連串的抗議行動。2019年開始動工興建，藻礁公投推動聯盟持續觀察施工狀況，其中漂沙更是關注的焦點。
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在施工過程中，藻礁公投推動聯盟發現在G1區的藻礁，殼狀珊瑚藻被大量泥沙覆蓋，導致藻礁的殼狀珊瑚藻覆蓋率有降低的趨勢。他們憂心如果不改善淤積情況，碼頭、防波堤、棧橋連成半封閉的環境下，淤積日積月累，大潭藻礁將面臨窒息的緊急情況，未來G1區藻礁可能消失，G2區也將隨著不保，北白玉、南觀新都將嚴重受害。
爭點一：淤沙從哪裡來？對殼狀珊瑚藻有何影響？
藻礁公投推動聯盟召集人潘忠政認為是三接棧橋沉箱附近海底的沙、泥，因受到三接工程的擾動，隨海潮打上潮間帶，而對照殼狀珊瑚藻覆蓋率下降的時間，可以發現與沉箱施作的時間表緊密相關，淤泥、淤沙導致殼狀珊瑚藻覆蓋率持續降低。尤其以最靠近工區的G1區，殼狀珊瑚藻的覆蓋率降低最多，從2019年3月最高的84.3%，到2023年3月只剩14.3%，多孔隙環境被阻塞，生態受到嚴重影響。
受中油委託調查的海洋大學和中央大學都回應藻礁沙埋是海岸季節性的變動，時而露出，時而淤積的自然現象，颱風的侵襲也會造成沙埋現象的變化，2024年四次颱風也曾出現埋退交替。海洋大學副校長冉繁華也指出氣候變遷讓水溫增高，也不利殼狀珊瑚藻的生長。
爭點二：施工對保育類柴山多杯孔珊瑚的影響
根據中油所提供的觀塘藻礁重點生態監測成果，G1區和G2區的柴山多杯孔珊瑚歷次調查，從2019年至2024年數字有增加的趨勢，平均活群株數每季調查在70-120群株之間。
而在柴山多杯孔珊瑚的面積上，藻礁公投推動聯盟在實地量測後，發現柴山多杯孔的面積，與開發單位的調查報告有所出入，藻礁志工詳細比對，有的標註點面積都小於登錄的面積。
負責執行調查計畫的海洋大學回應，量測面積起起伏伏除了與潮汐有關之外，原本的量測方法，的確會有高估的情況出現，透過Image J軟體分析，面積量測會更為精確，但為了過去資料的延續性，所以還是保留原來的量測方式。
另外，藻礁公投推動聯盟現場勘查，一一調查標記有柴山多杯孔珊瑚的點位，發現多處柴山多杯孔珊瑚點位，「未發現」、「沙埋」、「死亡」、「白化」、「疑似白化」等狀況，在報告中都未確實註記，而從聯盟所紀錄的數據，整體趨勢來看，柴山多杯孔珊瑚的確有嚴重衰退的趨勢。
海洋大學副校長冉繁華表達，目前只能標示「未發現」、「沙埋」、「死亡」、「疑似死亡」，無法做白化的等級標示。他強調，白化可能是死亡前的徵兆，但白化並不代表就是死亡。他說明在G1區有沙子、細沙，在漲退潮的時候，會導致柴山多杯孔珊瑚的組織受損，但不等同牠就一定會死亡。
但藻礁公投推動聯盟召集人潘忠政回應無論測量方式的差異，還是珊瑚死亡認定上的困難，在三接工程啟動以前，柴山多杯珊瑚是生機盎然，沒有發生白化現象的。
爭點三：施工時藻礁礁體是否受到破壞？
另一個討論重點是，藻礁礁體是否受到施工破壞？藻礁公投推動聯盟紀錄到三接興建棧橋橋墩以及臨時棧橋時，直接在藻礁礁體開挖。加上為了置放沉箱到海下，需夷平海底地表，為求穩固，所做的周邊防護措施，都讓礁體受損，而被破壞的藻礁礁塊碎屑，就隨著潮水漂到新屋永興海灘，堆積大約20-50公分。
海洋大學副校長冉繁華表示的確在永安觀新一帶，發現到藻礁破碎的屑塊，但是否與工程有關，還需要再釐清。中油則回應三接工程之前，就經常有藻礁碎屑的產生，也將藻礁碎屑委託中興大學林幸助老師做判斷，屬於圓形塊狀，並非是工程所造成。對此，藻礁公投推動聯盟回應也有發現尖銳型礁塊。
沉箱暫放位置與棧橋落柱有沒有破壞到藻礁呢？
中油表示曾在2021年作過水下ROV攝影，並且做過岩心鑽探，目測為礁體的也非藻礁；另外暫存沉箱區底下皆為沙質環境，並未有藻礁。而這次在三接，所採取的沉箱工法，會先鋪襯墊再拋石，並不會破壞到海床，也不做浚深的動作，對藻礁不會造成破壞。藻礁公投推動聯盟則回應在2018年10月23日的環現差說明書第127頁，水下ROV攝影結果顯示，觀測到有許多礁體的存在，對照外推方案後，認為目前的棧橋、碼頭後線、外海防波堤的下方都有藻礁。
針對以上的疑慮，藻礁公投推動聯盟呼籲請第三方公正單位來釐清爭點，中油表示執行計畫的海洋大學是學術單位，也就是所謂的第三方公正單位；而海洋大學也認為在地團體的加入，可擔任第三方公正單位，透過共同參與來解決疑慮，雙方對此未有共識。
