大溪溪的魚、蝦、蟹、螺，有九成以上屬於河海洄游生物，或是會在淡水與海水交會處活動，溪流廊道的暢通，對牠們來說非常重要。但從2016年起，水土保持局台北分局，在這裡設置的七座固床工陸續完工後，上溯就成了一場障礙賽。
固床工成為高牆 魚兒各種辦法往上游
雖然這幾座固床工剛完工時相對低矮，但人禾基金會資深經理方韻如觀察到，固床工設置後，往往會使水流的衝擊力道集中在固床工下方，久而久之，溪水的淘刷讓落差越來越大，形成一道對於大口湯鯉、黑邊湯鯉等游泳型魚類來說，難以躍過的高牆。
攀爬型的日本禿頭鯊，雖然能靠腹鰭特化的吸盤往上爬，但為了避開固床工中央的強勁水流，只能全部集中在兩側水流較緩處，增加暴露在白鷺鷥等天敵嘴下的風險。
根據中山大學海洋科學系教授廖德裕團隊的調查，整治工程完工後，大溪溪的水生生物，出現從下游到上游遞減的現象，即使是攀爬能力最好的日本禿頭鯊，也都集中在最靠近出海口的第一支固床工下，與上游的數量差距可達十倍之多。
而在固床工上方，因為整治後的坡度變平緩，容易使流速減弱，形成淤積，這些淤積的顆粒又沒有機會被壓實，使溪水在枯水期容易往下滲漏。2016到2020年，大溪溪就發生過七次斷流，居民只能盡力搶救被困在小水坑裡的魚。
居民組織巡守隊 發起封溪護魚
許多家住大溪溪旁的居民，對這條溪豐富的生態都如數家珍，他們自2019年發起封溪護魚，也自行組織巡守隊，斷流時屍橫遍野的景象讓他們非常心痛。頭城鎮大溪里里長藍五富說：「我在這裡生活快六十年，從來沒發生過什麼大災害，而且這一帶已經接近出海口，坡度很平緩，我是認為不需要設固床工。」
水土保持局台北分局表示，第六固床工旁的凹岸，因水流沖刷有崩坍現象，2013年有民意代表陳情希望整治，會設置這麼多固床工是因為，下游的固床工可以保護上游固床工的基腳。
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多方協商後降低固床工 大口湯鯉等棲地面積漸恢復
不過方韻如認為，從整治前的歷史流路來看，大溪溪是相對穩定的溪流，即使沒有固床工，發生災害的風險也很低。2020年起，在地居民、民間團體與水保局展開多次協商，當年七月，先降低第一固床工的高度，並在今年四月，降低第二到五座固床工，經過現勘討論後，決定把第一固床工的缺口再擴大，讓溪流有更多擺盪的空間。
時間來到六月底，改善工程完工約三個星期後，廖德裕與學生再度來到大溪溪做調查，在第六固床工下游的調查點，大口湯鯉及黑邊湯鯉的總數，從三十幾尾上升到一百四十幾尾，顯示降低固床工，讓牠們能夠利用的棲地，回復到接近整治前的面積。
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然而與此同時，台灣還有很多溪流存在類似問題，鄰近大溪溪的梗枋溪，出海口往上約三百公尺就有一座高約一公尺的固床工，廖德裕的研究團隊同樣在那裡觀察到，固床工上游的生物種類比下游少很多。他建議應通盤檢討這些早期興建的人工構造物，並表示：「如果有更多溪流能做類似大溪溪的改善，我想對生態保育會是非常正面的。」
與仍然在各種障礙賽中奮鬥的魚兒相比，大溪溪的魚兒，已經幸運很多，期望人工構造物設置的必要性，能有更審慎的評估，讓更多溪流裡的生物，可以來去自如。
