1982年，聯合國召開全球環境會議，《生物多樣性公約》第八章中，所有締約國均應避免引入，並控制、減除對生態系、棲地或物種產生威脅的外來種。根據美國國家科學委員會估算，臺灣全島的生物約有15萬種，占全球物種的1.5％，物種密度為全世界最高的地區之一，其中有三萬五千至五萬物種為臺灣特有種，然而臺灣目前所知的物種，只有十分之一不到。
臺灣有外來植物引進始於荷蘭治台時期，日治後引入的外來植物超過1,100種，1970年代文獻顯示，外來植物已有2500種以上，其中歸化植物超過170種，占全部引入種的7%。
林業試驗所生物系主任潘富俊以香澤蘭為例，說明外來種與臺灣原生種藤本植物的不同，由於藤本植物需要充足的陽光，必須攀附其他物體之上，原生種懂得如何與其他植物協調共存，而外來種不是，其生長方式是全部覆蓋，對臺灣特有種將造成危害。除了繁殖力強之外，再以銀合歡為例，其葉子的化學成分一旦留在土壤裡，將防止其他植物發芽與生長，即毒他作用。
適應水域汙染嚴重的琵琶鼠魚，因為耐旱加上外型特點，在高屏溪裡非常強勢，由於其原棲地位於中南美洲的乾淨水域，因此讓人擔心極可能慢慢地入侵乾淨河段，讓原本已經飽受吳郭魚威脅的淡水魚又增加新的壓力，2000年採樣結果，琵琶鼠魚數量為吳郭魚的一半，沒有其他魚種。
當人可以搭著輪船飛機往來世界各地的時候，動植物遷移的速度其實也跟著快了起來。外來物種絕大多數是被為了經濟目的，被人們刻意從國外引進而在台灣島上繁衍生長，也有一些是跟著引進種意外偷渡而來。
高雄師範大學生物科學研究所助理教授梁世雄認為，要防範外來種，只靠防檢疫並不安全，最好的防治法是限制外來種進入臺灣的生態系統，一旦牠能建立完全的生活史之後，所面對的將是整個生態系統的問題。
