為何台南鐵路要地下化？
隨著人口增加和都會發展，地面鐵軌將城市切割，造成前後站發展不均以及交通安全隱憂，為了縫合都市紋理，政府推動鐵道走向地下化，台南是繼台北、高雄鐵路地下化之後，第三個鐵路地下化的城市。2003年行政院將此案納入五年五千億的「新十大建設」。
南鐵地下化的規劃?
台南鐵路地下化歷經多次不同方案的研擬，在1995年規劃階段，鐵道局規劃從台南市大橋車站至大林路平交道以南約0.6公里處，全長約8.23公里，並增設林森與南台南兩站，預估經費293.6億元，後追加至412.6億元，由中央和地方共同負擔。地下化工程穿越台南市北區、東區和仁德區，將消除鐵路沿線9處平交道、8處地下道、2處鐵路橋涵及4座陸橋等23處設施，騰空後的土地將規劃約30公尺寬的公園廊道，由交通部鐵道改建工程局(簡稱鐵改局或鐵工局，後整併為鐵道局)負責推動，整體施工期程預計至2030年。
南鐵東移的爭議:從原軌地下化到東移方案
台南鐵路地下化是當地居民滿懷期待的公共建設，但2007年鐵道局改變工程方案，是引發爭議的開端。
原本方案是原軌地下化為主，徵用兩側民地施作臨時軌，待工程完成後再將土地歸還居民。2007年，交通部鐵路改建工程局(簡稱鐵工局或鐵改局，後整併為鐵道局)提出東移方案，改採徵收鐵道東側民間土地，興建永久軌道的方式，影響沿線三百多戶，反徵收居民為捍衛居住權成立自救會，展開長期抗爭。
對於方案的變更，鐵道局回應，考量台南車站被指定為國定古蹟，為了避免破壞文化資產、影響台鐵營運，以及減短施工時程、經費等因素，才決定變更為徵收鐵道東側土地做永久軌，施作工法也從潛盾工法變更為明挖覆蓋工法。
2009年「東移方案」經行政院核定通過，自救會在抗爭期間，一再提出替代方案。為了釐清雙方爭議，2013年2月台南市政府舉辦工程技術論壇，邀集專家學者來評估鐵道局和自救會的方案。鐵道局在論壇上回應潛盾工法所允許的施工沉陷量只有0.5公分，考量到施工難度及風險，因此採用明挖覆蓋工法，並強調能縮短施工時間，減少台南市民交通黑暗期。
大地工程師王偉民提出只要補強結構安全，就算是採用明挖覆蓋法也無需東移，不用徵收居民土地，在論壇中，鐵工局和台南市政府以施工風險、安全考量、施工時程等因素，認為替代方案不可行，即便也有土木專家提出民間版本在技術上並非不可行，在爭議聲中，鐵路地下化工程朝東移方案持續推進，通過環評、都審會等程序。
反徵收的住戶認為東移工程推動中，缺乏充分溝通，並且鐵道東側也有公有地，不需徵收民間土地，質疑徵收的必要性何在? 2020年起，拒絕拆遷的抗爭戶，住家陸續遭到強制拆除。
南鐵東移的爭議:拆遷、安置與補償
行政院核定東移案後，原本徵收東側沿線407戶民宅與土地，後來調整為340戶(後經台南市府再次調查爲323戶)。台南市政府表示，針對被徵收戶提出多元補償方案，包括微拆或半拆戶，拆除後有剩餘土地及建物可利用的住戶可以就地整建、原地新建；部分住戶也可合併新建、簡易都更等方式，則是會提供適度的補償或獎勵容積來重建房子；另外拆遷戶也能以優惠價格申購專案照顧住宅，4棟15層高建築總戶數為366戶。
不過，對於房屋全拆、土地被全數徵收的住戶來說，搬遷後要維持原有的居住條件是一大難題。有居民表示按照「臺南市鐵路地下化工程拆遷戶專案照顧住宅申購作業要點」，一個門牌號碼只能申購一戶照顧住宅，有的拆遷戶是原本與家人同住的大家庭，新住處根本無法容納全部的家庭成員；有的拆遷戶則表示，補償費用過低根本無法承購照顧宅，居民只能貸款；就算是擁有畸零地可與鄰地整建，但也可能引發法律糾紛，還有更重要的是，關於家的記憶。
此外，拆遷戶申購的照顧住宅，若是最後有空屋，台南市府可以進行標售，學者也對這樣的做法提出質疑，認為可能有圖利他人的疑慮。
地下化之後的土地開發
依照台南市政府規劃，鐵路地下化以後，台南車站周邊將配合多元複合機能招商需求，辦理都市計畫變更為車站專用區，導入文化、商業、休閒及交通樞紐機能。未來除了轉運站、旅館住宿、辦公及商場，也有住商混合區以及文化展示、創意等空間規劃。
反東移自救會陳致曉質疑地下化軌道方案的變更，與土地開發利益有關。除了在經建會第1367次會議紀錄「為顧及本案與周圍整體規劃開發，以土地開發利益回饋軌道運輸建設，提高本案之自償率，並提升整體規劃效能等因素，本案應將土地開發機制與軌道運輸建設整合一併推動」寫明之外，陳致曉也指出東移方案可開發土地寬度就從40公尺變為80公尺，估算出來的土地開發利益將超過512億。
鐵道局則是表示隧道上方及原有軌道拆除後騰空的土地將開闢為公園綠地及道路使用。台南市政府也曾表示，總經費全數由政府出資興建，毋須取得私有土地進行開發籌措財源，且工程用地範圍及公園道土地，全數供作交通事業及市區道路公共使用，並沒有移作其他開發建築使用。
對城市而言，鐵路地下化有助縫合鐵道兩側的都市紋理，改善交通，促進城市新面貌的展現；但對於被強制拆遷的居民來說，這項公共建設剝奪了他們的安居樂業的權利，留下心中難以弭平的傷痕。在後續地下化施工期間，也陸續還發現到十多處的文資遺構，包括史前的蔦松文化與大湖文化，清代城垣遺跡、人骨墓葬與糖間遺構，以及日治時期的南北轉車台等，是台南重大的文資發現，而衍生調查與保存等課題。
隨著列車駛入地下，看不見的，不只是地面上的風景，還有那些消失的地景地貌，以及居民原本的生活。當台南這座城市邁向新的階段，回顧南鐵東移爭議，這些關於公共決策、居民權益、土地徵收制度與都市發展的問題，仍值得我們持續檢視。
簡要大事記
1991年 交通部鐵改局接手規劃台南鐵路地下化
1996年 「台南市區鐵路地下化工程有條件通過環評
1998年 台南火車站公告為省定古蹟，精省後改列國定古蹟
2003年12月行政院將台南市區鐵路地下化納入5年5000億新十大建設
2007年 交通部鐵工局原軌地下化方案變更為東移方案
2009年9月 行政院核定東移案，需拆除東側407戶民宅，徵收土地
2010年6月「 臺南市區鐵路地下化工程環境影響差異分析報告」通過環評審查
2012年 反拆遷的3百多戶成立「反台南鐵路東移自救會」，訴求改回原軌地下化方案
2013年2月 台南市府舉辦鐵路地下化工程技術論壇討論鐵工局和民間版本方案
2014年4月 台南市政府辦理鐵路地下化相關都市計畫公展
2016年8月 內政部都委會通過南鐵東移案都市計畫變更案審查
2017年台南鐵路地下化專案照顧住宅完工
2018年9月內政部土徵小組通過「臺南市區鐵路地下化計畫東區及北區徵收土地案」。
2020年6月鐵道局首次強制執行拆除拒遷戶張家
2020年7月及10月 鐵道局多次到拒遷戶陳致曉及黃春香住家進行拆除，遭聲援民眾阻擋拆除，最終陳致曉住家遭到拆除，黃春香住家遭部分拆除。
2021年8月 鐵道局拆除黃春香住家，並執行接管。
2026年9月10日 總統賴清德出席台南車站新站揭牌典禮，向遭拆遷住戶致歉。
2026年10月17日台南鐵路地下化第一階段正式通車。
