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民國90年9月5日，雲林縣虎尾鎮廉使里的200公斤鎘米終於被查獲，正當全國民眾鬆一口氣時，農地污染問題才開始昭然若揭。早在十年前，廉使里就被檢驗出鎘污染事實但是當地仍然繼續生產、繼續耕作; 更令人憂心的是事實廉使里灌排未分離、工廠緊臨農地的情況，只是台灣眾多農地中的鳳毛麟角，隱藏在雲林鎘米之後的，是全面性的農地污染問題...
磺溪發源自陽明山竹子湖地區，流經士林天母，在建德橋與雙溪匯流而後流入基隆河，由於兩岸的污水排入磺溪，使磺溪生態岌岌可危。磺溪另外一個危機是面臨水泥化的威脅，防洪工程讓下游堤岸全面加高，由於堤防是居民平時休閒散步的主要空間，對於防洪工程居民有話要說。
故事從2001年6月的三腳渡開始，這裡是基隆河上唯一還在運作的渡船頭，昔日渡人今日都已年近花甲，今年老人們破天荒決定組一隻龍船隊參加台北國際龍舟比賽，他們究竟會不會獲勝呢？在幾乎同一時間，大台北地區的污水處理系統，因為一條重要管線破裂，必須停止運作兩星期，進入管線修復，這段期間大台北地區所有已經接管的污水，都必須繞過正常的系統，直接排入淡水河，稱為繞流作業。每天132萬噸的污水，在此期間都必須從一個放流口直接注入河川。
新竹科學園區成立二十年，是台灣高科技產業IC製造重鎮，也是國家經濟的命脈。但是年產值近一兆元台幣的新竹科學園區，卻沒有相對應的環保工業。特別是針對流經新竹縣市的客雅溪所造成的污染，早已是一個不爭的事實。本集將披露由於園區工廠生產製程的多樣化，及有害化學物質的經常性使用，使得新竹科學園區在保護環境資源，及對污水的污染管制方面，有其侷踀與困難。然而從物原料的使用上，來減少廢棄物的產生，卻是目前唯一且最經濟的解決方法。
桃園觀音有片綿延四公里長的藻礁地形，從空中鳥瞰是如此壯闊，長年污染斷絕了藻礁的生命力，而觀塘工業區的設置，更將摧毀藻礁僅存的遺體，台灣的藻礁很可能在我們還來不及認識它的時候就消失。
中福村中興段的農田，一百多年來是桃園縣蘆竹鄉最好的水稻田，但是1976年左右，中壢工業區的工業污水陸續排放到黃墘溪以後，只要附近的農民引用黃墘溪水灌溉，農田就會遭受污染，目前這片農田快要成為桃園地力最差的地方。 農業工程研究中心的調查，中福地區受到重金屬汙染的土地大概有八十幾公頃，2001年3月6日，臺灣大學教授胡弘道在這裡種植桉樹樹苗，進行土壤復育試驗，他分析此區鎘污染量已經超過痛痛病的標準，...
