黎明時刻，台灣最南端的鼻頭角漁港，朱太平船長駕著漁船，緩緩開向蔚藍海洋，依照魚類的洄游季節，進行捕魚工作。長期以來，朱船長堅持傳統捕魚，以延繩釣方式，用智慧與經驗，釣取鬼頭刀、芭蕉旗魚等魚類。
放下釣鉤，漁船開始緩行，讓海裡的餌，像魚兒慢游，引誘大魚追食。朱船長練就了手操船舵，腳勾魚線。幾次失敗，大魚吃了餌，卻不上鉤。最後終於讓他釣上一尾鬼頭刀，海中追食飛魚的獵食者。朱船長用傳統捕魚方式，維繫生活，卻發現海裡的魚越來越少，他覺得是人類太會抓，讓牠們來不及休養生息，繼續繁衍。
盛大的王船祭在東港展開，讓南台灣最重要的漁業港口，成了一座不夜城。漁民透過迎送瘟王的祭典，期待避禍消災，也希望保佑豐收。
五月的東港碼頭，許多鮪釣船紛紛靠岸，一頭頭鮪魚從船艙中搬出。船長們抱怨，現在鮪魚的捕捉量越來越少。根據鮪釣公會統計，台灣在三大洋作業的鮪釣船，數量維持在500艘左右，2004年捕獲量高達12萬噸，接下來就年年下降，許多捕鮪船開始面臨低魚獲、高成本的問題。
鮪魚陳列在拍賣場上，開始競標。2013年第一尾捕獲回港的300公斤鮪魚，拍賣了一公斤5888元的高價。但是船長說，第一尾搶標喊高價，後來實際價格，其實沒那麼高。在台灣，釣鮪船等遠洋漁業的收益，佔台灣漁業產值的一半，但因為在公海作業，一些漁權糾紛，加上各國限漁政策，讓遠洋漁業深具不確定性。
當各地漁民與海洋搏鬥之時，台灣雲林卻有一群漁民，為著環境惡化、失去漁場而苦惱著，他們走上街頭，發出怒吼。在雲林縣政府會議室裡，向台塑六輕索賠。
漁民們拿出六輕在麥寮設廠前後的漁獲比較，認為台塑危害海域，讓漁民捕不到魚。但是台塑代表，拒絕了賠償的定義，認為應該用回饋的方式，而金額計算必須再討論。
海域污染造成環境惡化，還有過漁濫捕，加速了海洋生態的惡化，甚至有國外學者提出警告，再不重視海洋保育，50年後，世界會捕不到魚。但是，面對海洋資源的匱乏，政府始終提不出一套有效政策，甚至在漁船減量，劃設保護區上，依舊進行緩慢。
為了搶救海洋生態，一些民間自力展開行動，用微薄力量，進行海洋保育。阿兼伯，是澎湖七美的老漁民，開著小舟，搭載唐先柏老師，來看一塊珊瑚礁保護區。這塊位於七美海岸旁的珊瑚礁區，面積並不大，阿兼伯和幾位漁民共同保護，下海清漁網，排除砂石覆蓋，希望珊瑚能擴大，重建魚類生態。
在七美漁港的倉庫中，陳船長進行著廢電池回收工作，一袋袋廢電池，佔滿整個房間。他回收的舊電池，都是船上浮標的燈光電池，過去習慣用完就往海裡丟，現在推動各漁船帶回回收，換取新電池，不要污染海域。陳船長也是九孔養殖戶，他希望海域清潔，對生態好，也能避免污染，有利養殖。幾年的推動，相當辛苦，卻也讓八成廢電池回收回來。
七美的小小海洋保育行動，成為偏遠離島的美麗星火，一路陪伴推動的唐先柏老師，希望結合外界資源，推銷保護環境的漁產，也給予漁民經濟支持。
海中抓不到魚，養殖漁業成為一種取代方式，雲林養殖漁民莊國顯，用純海水養殖烏魚。根據農委會統計，台灣漁業養殖戶高達四萬多戶，創造200多億產值，但是養殖漁業過度抽水，造成地層下陷，加上浮濫用藥，危害健康與污染環境，都成為新的問題。莊國顯知道問題的嚴重性，十年前就轉型自然生態的養殖技術。
十年下來，莊國顯的烏魚養殖，獲得認證，精製的烏魚子，更是獲獎無數，但是至今最苦惱的，依舊是地層下陷的苦果，一碰上天災豪雨，就是巨大損失。
台灣漁業面對困境，民間都在找出路，當漁業一級捕撈、二級加工，都有因應方法，三級的觀光發展，也開始嘗試新作法。在高雄蚵仔寮漁港，當地居民舉辦一場小小音樂會，希望遠方遊子回到故鄉，也讓大家來漁港聽音樂。
沒想到透過網路宣傳，一場港邊吹海風聽音樂的晚會，竟然吸引上千人參加，高雄市長陳菊也主動前來。晚會現場人群擁擠，寫下民間自辦活動的傳奇，許多遊客透過音樂會，都想來看看這個漁港村落。
海洋有難、生態破壞、魚類減少，受難的不是人類無魚可吃，而是整個生態鏈的斷裂，形成無可估計的生態浩劫。當魚不再來，民間不能坐以待斃，從海洋保育、觀念轉變開始，重新尋找海洋新生機。
